எல்-சிஸ்டைன் முக்கியமாக மருத்துவம், அழகுசாதனப் பொருட்கள், உயிர்வேதியியல் ஆராய்ச்சி ஆகியவற்றில் பயன்படுத்தப்படுகிறது; பசையம் உருவாவதை ஊக்குவிக்கவும், நொதித்தல், அச்சு மற்றும் வயதானதைத் தடுக்கவும் ரொட்டிப் பொருட்களில் பயன்படுத்தப்படுகிறது. வைட்டமின் சி ஆக்ஸிஜனேற்றப்படுவதைத் தடுக்கவும், சாறு பழுப்பு நிறமாக மாறுவதைத் தடுக்கவும் இயற்கை சாறுகளில் பயன்படுத்தப்படுகிறது. தயாரிப்பு நச்சுத்தன்மை விளைவைக் கொண்டுள்ளது, அக்ரிலோனிட்ரைல் விஷம், நறுமண அமிலத்தன்மைக்கு பயன்படுத்தலாம்.
அசிடைல்சிஸ்டைன், என்-அசிடைல்சிஸ்டீன் அல்லது என்-அசிடைல்-எல்-சிஸ்டைன் (என்ஏசி) என்றும் அழைக்கப்படுகிறது, இது அதிகப்படியான மருந்துகளுக்கு சிகிச்சையளிக்க மற்றும் சிஸ்டிக் ஃபைப்ரோஸிஸ் அல்லது நாள்பட்ட தடுப்பு நுரையீரல் நோய் போன்ற தடிமனான சளியை தளர்த்த பயன்படும் மருந்து ஆகும்.